ABSTRACT
O presente estudo pesquisou o melhor algoritmo de testes laboratoriais para efetuar o diagnóstico de infecção por vírus linfotrópicos de células T humanas dos tipos 1 (HTLV-1) e 2 (HTLV-2) em pacientes HIV-1 positivos. Amostras de sangue de 1.608 pacientes do CRT DST/Aids-SP foram analisadas quanto à presença de anticorpos específicos usando-se dois ensaios de triagem (EIA Murex HTLV-I+II e Gold ELISA HTLV-I/II), dois confirmatórios [HTLV Blot 2.4 (Western Blot WB) e INNO-LIA HTLV I/II (Line ImmunoAssay - LIA)] e um molecular (PCR em tempo real pol). Na triagem foram detectados 51(Murex) e 49 (Gold ELISA) soros reagentes. Pelo WB, 23 soros confirmaram infecção por HTLV-1, 12 HTLV-2, seis HTLV e nove apresentaram perfis indeterminados. O LIA detectou 24 soros HTLV-1 positivos, 20 HTLV-2 e seis HTLV. A PCR evidenciou segmento pol de HTLV-1 em 18 e HTLV-2 em 12 amostras de sangue. Pelos testes confirmatórios, em 50 pacientes foi confirmada a infecção por HTLV: 25 HTLV-1 (1,55 %), 21 HTLV-2 (1,31 %) e quatro HTLV (0,25 %). As sensibilidades do LIA, WB e PCR foram de 96 %, 76 % e 60 %, respectivamente. Considerando-se apenas o custo, o melhor algoritmo diagnóstico para população infectada pelo HIV-1 foi o uso da PCR seguida do LIA...
Subject(s)
Humans , HIV-1 , Coinfection , HTLV-I Infections/diagnosis , HTLV-II Infections/diagnosis , AIDS Serodiagnosis , Laboratory TestABSTRACT
O Brasil é considerado o país com o maior número absoluto de indivíduos infectados pelos vírus linfotrópicos de células T humanas dos tipos 1 e 2 (HTLV-1 e HTLV2), perto de 2,5 milhões; além disso, é também considerado epidêmico para o HIV e, portanto, casos de coinfecção HIV/HTLV são frequentes no país. O presente trabalho efetuou o seqüenciamento das regiões LTR, env e tax do genoma proviral do HTLV-1 e do HTLV-2 isolados das amostras de sangue de pacientes coinfectados pelo HIV-1 de Londrina e região (n=34) e de São Paulo (n=20), para realizar a caracterização molecular e determinar subtipos virais. Foram utilizadas na análise das sequências as ferramentas Sequencher 4.7, BLAST, Genotyping-NCBI, Subtyping-REGA, BioEdit 7.0.5.3, ClustalW, GenBank, PAUP 4.0.b10, Modeltest 3.7, TreeView 1.6.6 e MEGA4. As diversas análises confirmaram como subtipos prevalentes o HTLV-1a, subgrupo Transcontinental A, e o HTLV-2a (variante -2c). Foram detectadas assinaturas moleculares nos isolados do Brasil. Detectou-se o genótipo brasileiro taxA para o HTLV-1 e para o HTLV-2 a Tax longa, a qual é característica da variante HTLV-2c. Houve também a confirmação da troca de aminoácido S1909P no env dos HTLV-2. Especulou-se sobre duas entradas do HTLV-1 no Brasil e sobre a disseminação do HTLV-2c em grupos distintos quanto ao comportamento de risco e região geográfica. O estabelecimento de métodos laboratoriais otimizados para isolados brasileiros de HTLV-1 e HTLV-2 possibilitou melhor compreensão da diversidade genômica e da origem e disseminação dos HTLVs em populações coinfectadas pelo HIV no Brasil
Brazil is considered the country with the major absolute number of individuals infected with human T-lymphotropic virus types 1 and 2 (HTLV-1 and HTLV-2), close to 2,500,000; moreover, it is also considered epidemic for HIV/Aids =and therefore HIV/HTLV coinfection is frequent in the country. This study aimed at sequencing the LTR, env and tax regions of the proviral genome of HTLV-1 and HTLV-2 isolated from blood samples obtained from patients coinfected with HIV-1 from Londrina and vicinities (n=34) and São Paulo (n=20), in order to perform the molecular characterization and viral subtyping. For sequences analysis, several bioinformatics tools were employed: Sequencher 4.7, BLAST, Genotyping-NCBI, Subtyping-REGA, BioEdit 7.0.5.3, ClustalW, GenBank, PAUP 4.0.b10, Modeltest 3.7, TreeView 1.6.6 and MEGA4. The results confirmed as prevalent the HTLV-1a subtype, the Transcontinental subgroup A, and the HTLV-2a (variant-2c). Molecular signatures characteristic of Brazilian isolates were detected: taxA Brazilian genotype in HTLV-1, and the long Tax which is characteristic of the HTLV-2c in HTLV-2. Also, it was confirmed the S1909P amino acid change in the env region of HTLV-2c. It was speculated on two entrances of HTLV-1 in Brazil, and on the spread of HTLV-2c in distinct groups related to risk factors and geographic region. The establishment and optimization of laboratory methods performed in this study allowed to get a better understanding on HTLVs genomic diversity, and to give insights on the origin and spread of HTLVs in populations coinfected with HIV in Brazil